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乙肝核心病毒样颗粒稳定性的分子动力学模拟研究
学位论文
: 中国科学院大学, 2020
作者:
马艳艳
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浏览/下载:20/0
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提交时间:2021/09/07
Hbc-vlps,分子动力学模拟,介电常数,Mm-pbsa,结合自由能
Biodegradation mechanism of polyesters by hydrolase from Rhodopseudomonas palustris: An in silico approach
期刊论文
CHEMOSPHERE, 2019, 卷号: 231, 页码: 126-133
作者:
Wang, Xiaodan
;
Chen, Jinfeng
;
Tang, Xiaowen
;
Wang, Junjie
;
Zhu, Ledong
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浏览/下载:5/0
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提交时间:2019/12/11
Quantum mechanics/molecular mechanics
Polyester
Enzymatic
transformation
MM-PBSA
Systems Pharmacology Dissection of Multiscale Mechanisms of Action for Herbal Medicines in Treating Rheumatoid Arthritis
期刊论文
MOLECULAR PHARMACEUTICS, 2017, 卷号: 14, 页码: 3201-3217
作者:
Wang, Jinghui
;
Li, Yan
;
Yang, Yinfeng
;
Du, Jian
;
Zhao, Miaoqing
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浏览/下载:4/0
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提交时间:2019/12/03
Rheumatoid arthritis
TCM
Systems-Pharmacology
MD
MM-PBSA
Effect of Force Fields and Water Models on EGFRvIII-MR1 (scFv) Complex by Molecular Dynamics Simulation, MM-PBSA Calculation, and ITC Experiment
期刊论文
CHEMICAL JOURNAL OF CHINESE UNIVERSITIES-CHINESE, 2017, 卷号: 38, 页码: 2070-2076
作者:
Ren Jiayi
;
Yang Zhiwei
;
Zheng Nianjue
;
Li Junqi
;
Yang Chunlong
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浏览/下载:3/0
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提交时间:2019/11/26
Root mean square deviation (RMSD)
Single-chain variable fragment (scFv)
Molecular dynamics (MD) simulation
mechanics/Poisson-Boltzmann surface area (MM-PBSA)
Isothermal titration calorimetry (ITC)
Molecular
分子动力学研究抗体SPE7与抗原Alizarin red的相互作用机制
期刊论文
2017, 卷号: 54, 期号: 2, 页码: 340-346
作者:
刘进庆[1]
;
梁志强[1]
;
王伟[1]
;
伊长虹[1]
;
李洪云[1]
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浏览/下载:2/0
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提交时间:2020/01/04
分子动力学
抗体
MM—PBSA
结合自由能
回旋半径
SIE
Binding mode of chitin and TLR2 via molecular docking and dynamics simulation
期刊论文
MOLECULAR SIMULATION, 2016, 卷号: 42, 期号: 11
作者:
Shen, Peicheng
;
Li, Wenwen
;
Wang, Ying
;
He, Xiao
;
He, Liqun
收藏
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浏览/下载:10/0
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提交时间:2019/12/05
IgAN
toll-like receptor
traditional Chinese Medicine
molecular docking
molecular dynamics simulation
MM
PBSA
binding free energy
Novel binding patterns between ganoderic acids and neuraminidase: Insights from docking, molecular dynamics and MM/PBSA studies
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, 2016, 卷号: 65, 期号: [db:dc_citation_issue], 页码: 27-34
作者:
Yang, Zhiwei
;
Wu, Fei
;
Yuan, Xiaohui
;
Zhang, Lei
;
Zhang, Shengli
收藏
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浏览/下载:2/0
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提交时间:2019/12/02
Ganoderic acids
Docking
Interactions
MM/PBSA
Neuraminidase
Molecular dynamics
Computational Study Exploring the Interaction Mechanism of Benzimidazole Derivatives as Potent Cattle Bovine Viral Diarrhea Virus Inhibitors
期刊论文
JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY, 2016, 卷号: 64, 页码: 5941-5950
作者:
Wang, Jinghui
;
Yang, Yinfeng
;
Li, Yan
;
Wang, Yonghua
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浏览/下载:6/0
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提交时间:2019/12/09
BVDV RdRp
3D-QSAR
docking
molecular dynamics
MM-PBSA
抑制剂8CA与脂肪细胞脂肪酸结合蛋白(A-FABP)结合模式的分子动力学研究
期刊论文
2016, 卷号: 33, 期号: 2, 页码: 339-344
作者:
尹妍妍[1]
;
梁志强[1]
;
王伟[1]
;
伊长虹[1]
;
李洪云[1]
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浏览/下载:4/0
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提交时间:2020/01/01
分子动力学模拟
MM-PBSA方法
A-FABP
抑制剂-残基相互作用
Molecular dynamics and principal components of potassium binding with human telomeric intra-molecular G-quadruplex
期刊论文
PROTEIN & CELL, 2015, 卷号: 6, 期号: 6, 页码: 423-433
作者:
Wang, Zhiguo
;
Chen, Ruping
;
Hou, Ling
;
Li, Jianfeng
;
Liu, Jun-Ping
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浏览/下载:5/0
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提交时间:2019/12/17
G-quadruplex
potassium ion
molecular dynamics
principal component
analysis
MM-PBSA
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