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DMfold: A Novel Method to Predict RNA Secondary Structure With Pseudoknots Based on Deep Learning and Improved Base Pair Maximization Principle
期刊论文
FRONTIERS IN GENETICS, 2019, 卷号: 10
作者:
Li, Cong
;
Wang, Linyu
;
Liu, Yuanning
;
Zhong, Xiaodan
;
Liu, Haiming
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浏览/下载：19/0
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提交时间：2019/12/05
RNA
secondary structure prediction
pseudoknot
deep learning
multi-sequence method
single-sequence method
improved base pair maximization principle
Effects of flanking regions on HDV cotranscriptional folding kinetics
期刊论文
RNA, 2018, 卷号: 24, 期号: 9
作者:
Wang, Yanli
;
Wang, Zhen
;
Liu, Taigang
;
Gong, Sha
;
Zhang, Wenbing
收藏
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浏览/下载：2/0
|
提交时间：2019/12/05
HDV ribozyme
cotranscriptional
folding kinetics
pathway
pseudoknot
Electrochemical detection of Nanog in cell extracts via target-induced resolution of an electrode-bound DNA pseudoknot
期刊论文
BIOSENSORS & BIOELECTRONICS, 2016, 卷号: 86, 页码: 933-938
作者:
Ma, Jiehua[1]
;
Li, Chao[2]
;
Tao, Yaqin[3]
;
Feng, Chang[4]
;
Li, Genxi[5]
收藏
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浏览/下载：7/0
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提交时间：2019/04/26
Electrochemical biosensor
Nanog
Cancer cells
Approximating the maximum multiple RNA interaction problem
期刊论文
理论计算机科学, 2014
Tong, Weitian
;
Goebel, Randy
;
Liu, Tian
;
Lin, Guohui
收藏
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浏览/下载：6/0
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提交时间：2015/11/11
RNA interaction
Maximum weight b-matching
Acyclic 2-matching
Approximation algorithm
Worst case performance ratio
INTERACTION PREDICTION
BINDING
Target-Responsive, DNA Nanostructure-Based E-DNA Sensor for microRNA Analysis
期刊论文
ANALYTICAL CHEMISTRY, 2014, 卷号: 86, 期号: 5, 页码: 2285—2288
Lin, MH
;
Wen, YL
;
Li, LY
;
Pei, H
;
Liu, G
;
Song, HY
;
Zuo, XL
;
Fan, CH
;
Huang, Q
收藏
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浏览/下载：26/0
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提交时间：2015/03/13
SEQUENCE-SPECIFIC DETECTION
ELECTROCHEMICAL BIOSENSORS
BLOOD-SERUM
LABEL-FREE
REAGENTLESS
PSEUDOKNOT
Dynamic matching algorithm for viral structure prediction
期刊论文
PAKISTAN JOURNAL OF PHARMACEUTICAL SCIENCES, 2014, 卷号: 27, 期号: 4, 页码: 1001-1004
作者:
Li, Hengwu
收藏
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浏览/下载：3/0
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提交时间：2019/12/17
RNA structure prediction
dynamic matching
pseudoknot
algorithm
algorithm
dynamic matching
pseudoknot
RNA structure prediction
A dynamical model of programmed-1 ribosomal frameshifting
期刊论文
JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY, 2013, 卷号: 336, 页码: 119
Xie, P
收藏
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浏览/下载：16/0
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提交时间：2014/01/16
Ribosome
Translation
Protein synthesis
RNA
Virus
Approximation algorithms for the maximum multiple RNA interaction problem
其他
2013-01-01
Tong, Weitian
;
Goebel, Randy
;
Liu, Tian
;
Lin, Guohui
收藏
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浏览/下载：4/0
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提交时间：2015/11/17
DNA pseudoknot-functionalized sensing platform for chemoselective analysis of mercury ions
期刊论文
ANALYST, 2012, 卷号: 137, 页码: 4425-4427
作者:
Fu, Libing
;
Zhuang, Junyang
;
Tang, Dianping
;
Que, Xiaohua
;
Lai, Wenqiang
收藏
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浏览/下载：3/0
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提交时间：2019/11/21
A Binary Coding Method for RNA Secondary Structure Alignment
期刊论文
Journal of Computational and Theoretical Nanoscience, 2010, 卷号: 7, 期号: 3, 页码: 619-622
作者:
Xiang, Xuyu
;
Liao, Bo*
;
Zhang, Dafang
;
Luo, Jiawei
收藏
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浏览/下载：2/0
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提交时间：2019/12/24
ALIGNMENT
CODING METHOD
PSEUDOKNOT
RNA SECONDARY
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