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一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法 专利
专利类型: 发明, 专利号: CN201210112325.X, 申请日期: 2012-10-10, 公开日期: 2012-10-10
作者:  刘保忠
收藏  |  浏览/下载:19/0  |  提交时间:2014/08/04
一种适用于文蛤家系鉴定的微卫星标记方法  2)引物设计:在微卫星重复的侧翼序列利用软件Primer?Premier?5.0设计引物  GC含量为40%?60%  退火温度为45?65℃  预期PCR产物长度为100?400bp  3)引物优化:根据不同引物的Tm值进行温度梯度优化  4)微卫星标记家系鉴定体系的确立:微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)衡量  包括微卫星位点来源  引物设计条件为:引物长度为19?25mer  在Tm值上下各10℃  根据上述优化获得的Ta值  引物设计  温度梯度优化扩增得到的PCR产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳?EB染色系统进行检测  选取多个体作为群体进行计算微卫星位点的多态性水平可用信息含量值(PIC)进而衡量多态性信息  引物优化和微卫星标记家系鉴定体系  选取杂带较少  根据PIC值  其特征在于:1)微卫星位点的来源:提取文蛤的基因组DNA利用提取的DNA  特异性产物亮度较高的PCR反应对应的温度为该引物的最佳退火温度Ta  PIC小于0.25的标记  采用限制性内切酶法获得文蛤基因组DNA片段  筛选得到重复性好  并构建微卫星磁珠富集文库  稳定性好  检测阳性克隆  PIC值大于0.25的位点  经测序得到含有微卫星重复的DNA序列  作为文蛤微卫星标记家系鉴定体系  用于文蛤的家系区分与个体识别。  


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