大洋表层沉积物中甲烷代谢古菌群落的组成及分布特征
刘皓3,5; 许秋彤1,5,6; 王春生2,4; 荆红梅2,3,5
刊名海洋学报
2023-01-10
卷号45期号:1页码:80-88
关键词大洋表层沉积物 甲烷代谢古菌 mcrA基因 高通量测序 实时定量PCR
ISSN号0253-4193
通讯作者荆红梅
文献子类期刊论文
英文摘要

海洋沉积物中的甲烷代谢微生物是甲烷循环的关键参与者,其代谢过程对大气甲烷浓度及全球气候变化具有显著影响,研究其在全球大洋沉积物中的组成及分布特征是探究微生物介导甲烷循环的基础。采用焦磷酸454高通量测序测定甲烷代谢保守功能基因mcrA(Methyl coenzyme–M reductase A)分析全球大洋沉积物中甲烷代谢微生物群落的组成和多样性;结合荧光实时定量PCR技术检测了古菌和甲烷代谢古菌的丰度分布特征。与其他海洋生境对比,大洋沉积物中甲烷代谢古菌群落结构单一,大西洋和印度洋的α多样性指数显著高于太平洋(p《0.05)。在大洋沉积物样品中鉴定到3个目的甲烷代谢古菌,即甲烷杆菌目(Methanobacteriales)、甲烷八叠球菌目(Methanosarcinales)和甲烷微菌目(Methanomicrobiales),其中甲烷微菌目占绝对优势,并主要由一簇未知类群(暂名Oceanic Sediments Dominant group,OSD group)组成。大洋沉积物的古菌16S rRNA基因丰度(湿重,下同)平均为8.81×10^(6) copies/g,大西洋的低于印度洋和太平洋;马里亚纳海沟基因丰度低于南海北部,且随着采样深度增加而呈降低趋势。大洋沉积物的mcrA基因丰度为1.38×10^(3)~8.25×10^(4) copies/g。基因丰度大西洋最高,太平洋次之,印度洋最低;马里亚纳海沟略高于南海。本研究发现,相较于冷泉、热液、近海河口等海洋生境,大洋沉积物中甲烷代谢古菌丰度低且群落结构单一,不同海区样品间具有极高的相似性;同时发现OSD group是全球大洋沉积物样品的绝对优势类群,其与已知类群序列亲缘关系均较远,分类进化地位尚不明晰,值得进一步研究。

URL标识查看原文
语种中文
内容类型期刊论文
版本出版稿
源URL[http://ir.idsse.ac.cn/handle/183446/10131]  
专题深海科学研究部_深海生物学研究室_海洋微生物分子生态学研究组
通讯作者荆红梅
作者单位1.海南省热带海洋生物技术重点实验室;
2.南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海);
3.中国科学院三亚海洋科学综合(联合)实验室;
4.自然资源部第二海洋研究所;
5.中国科学院深海科学与工程研究所中国科学院深海极端环境模拟重点实验室;
6.中国科学院南海海洋研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
刘皓,许秋彤,王春生,等. 大洋表层沉积物中甲烷代谢古菌群落的组成及分布特征[J]. 海洋学报,2023,45(1):80-88.
APA 刘皓,许秋彤,王春生,&荆红梅.(2023).大洋表层沉积物中甲烷代谢古菌群落的组成及分布特征.海洋学报,45(1),80-88.
MLA 刘皓,et al."大洋表层沉积物中甲烷代谢古菌群落的组成及分布特征".海洋学报 45.1(2023):80-88.
个性服务
查看访问统计
相关权益政策
暂无数据
收藏/分享
所有评论 (0)
暂无评论
 

除非特别说明,本系统中所有内容都受版权保护,并保留所有权利。


©版权所有 ©2017 CSpace - Powered by CSpace