基于分子对接技术的拟南芥植酸酶的水解特性 | |
袁凡; 周敏; 丁君辉; 彭晓赟; 徐文忠; 萧浪涛; 王若仲 | |
刊名 | 湖南农业大学学报(自然科学版)
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2019 | |
卷号 | 45期号:5页码:485-490+495 |
关键词 | 拟南芥植酸酶 水解 生物信息学 同源建模 分子对接 植酸 |
ISSN号 | 1007-1032 |
DOI | 10.13331/j.cnki.jhau.2019.05.007 |
英文摘要 | 采用生物信息学、同源建模、分子对接等方法,对拟南芥植酸酶(ATMINPP)的功能结构及其与植酸的分子对接模式进行了预测。结果表明:ATMINPP由487个氨基酸组成,其二级结构由18个α螺旋、6个β折叠、伸展片段和无规则卷曲等4个主要部分构成;保守半胱氨酸在螺旋结构之间形成4个二硫键;ATMINPP蛋白有2个结构域(α/β–结构域和α–结构域),活性位点位于2个结构域的中间;对接时,带负电的植酸结合在ATMINPP带正电的亲水性口袋内;保守序列RHGARYP中的His 66对植酸氢键所结合的磷酸基团进行亲核攻击,形成中间复合物,中间复合物水解得到磷酸和磷酸肌醇衍生物,His 343为解离基团氧原子提供质子,使得磷酸基团解离。 |
语种 | 中文 |
资助机构 | 国家自然科学基金项目(31671777、31871714) ; 长沙市科技局计划项目(KQ1801024) |
内容类型 | 期刊论文 |
源URL | [http://ir.ibcas.ac.cn/handle/2S10CLM1/23277] ![]() |
专题 | 中科院北方资源植物重点实验室 |
作者单位 | 1.植物激素与生长发育湖南省重点实验室 2.中国科学院植物研究所 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 袁凡,周敏,丁君辉,等. 基于分子对接技术的拟南芥植酸酶的水解特性[J]. 湖南农业大学学报(自然科学版),2019,45(5):485-490+495. |
APA | 袁凡.,周敏.,丁君辉.,彭晓赟.,徐文忠.,...&王若仲.(2019).基于分子对接技术的拟南芥植酸酶的水解特性.湖南农业大学学报(自然科学版),45(5),485-490+495. |
MLA | 袁凡,et al."基于分子对接技术的拟南芥植酸酶的水解特性".湖南农业大学学报(自然科学版) 45.5(2019):485-490+495. |
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