栽培花生Aux/IAA家族鉴定与生物信息学分析
方月哏旺; 张晓嘉; 何华; 胡华斌; 陈江华
刊名分子植物育种
2020
卷号18期号:10页码:3115-3125
关键词栽培花生 聚类分析 表达模式
ISSN号1672-416X
英文摘要

Aux/IAA (Auxin/Indole-3-Acetic Acid)家族是生长素(Auxin)信号的早期响应基因家族之一,广泛参与调控植物的生长发育。然而目前对于栽培花生(Arachis hypogaea) Aux/IAA家族的研究还未见相关报道。本研究在栽培花生中共鉴定到了34个Aux/IAA基因,分布在15条不同的染色上。多重序列比对分析发现花生Aux/IAAs具有4个保守结构域,分别为Ⅰ-Ⅳ。聚类分析将花生Aux/IAAs分为Ⅰ-Ⅷ,8个亚家族。各个亚家族内部基因具有相似的保守基序,而基因之间的内含子/外显子结构存在差异。基于基因表达模式分析将栽培花生分为A和B两组基因,A组基因在花生各个组织的表达量都相对较高,而B组基因的表达具有组织特异性。基于以上结果,本研究将为进一步对Aux/IAA家族的基因功能研究提供科学依据。

学科主题Agriculture (Provided By Clarivate Analytics)
语种中文
CSCD记录号CSCD:6722210
内容类型期刊论文
源URL[http://ir.xtbg.org.cn/handle/353005/11837]  
专题西双版纳热带植物园_2012年后新成立研究组
作者单位1.,
2.北京 650223
3.100049.
4.张晓嘉, 中国科学院西双版纳热带植物园
5.何华, 中国科学院西双版纳热带植物园, 中科院热带植物资源可持续利用重点实验室, 昆明, 云南 650223, 中国.
6.中国科学院大学, 中科院热带植物资源可持续利用重点实验室
7.胡华斌, 中国科学院西双版纳热带植物园, 中科院热带植物资源可持续利用重点实验室, 昆明, 云南 650223, 中国.
8.陈江华, 中国科学院西双版纳热带植物园, 中科院热带植物资源可持续利用重点实验室, 昆明, 云南 650223, 中国.
9., 昆明
10.方月哏旺, 中国科学院西双版纳热带植物园
推荐引用方式
GB/T 7714
方月哏旺,张晓嘉,何华,等. 栽培花生Aux/IAA家族鉴定与生物信息学分析[J]. 分子植物育种,2020,18(10):3115-3125.
APA 方月哏旺,张晓嘉,何华,胡华斌,&陈江华.(2020).栽培花生Aux/IAA家族鉴定与生物信息学分析.分子植物育种,18(10),3115-3125.
MLA 方月哏旺,et al."栽培花生Aux/IAA家族鉴定与生物信息学分析".分子植物育种 18.10(2020):3115-3125.
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