基于深度学习的miRNA与疾病相关性预测算法

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	基于深度学习的miRNA与疾病相关性预测算法
	王磊 ; 徐涛 ; 宋传东 ; 王海峰 ; 尤著宏 ; 宋克俭 ; 闫欣
刊名	电子学报
	2020
卷号	48 期号:5 页码:870-877
关键词	深度学习 miRNA-疾病关系堆叠自动编码器旋转森林
ISSN号	0372-2112
英文摘要	大量研究表明,microRNA(miRNA)在人类复杂疾病研究中发挥着重要作用.识别miRNA与疾病之间的关系对于提高复杂疾病的治疗水平具有重要意义.然而,传统实验方式常受限于小规模和高成本,因此迫切需要计算模拟的方式快速有效地预测miRNA-疾病间的潜在关系.本文通过结合深度学习的堆叠自动编码器算法与旋转森林分类器对miRNA-疾病间关系进行预测.该方法能够有效抽取出融合了疾病语义相似性、miRNA功能相似性和miRNA序列信息的高级特征并对其进行准确分类.在交叉验证实验中,该方法在HMDD v3.0数据集上取得90.30%的预测准确率.此外,我们还在人类复杂疾病乳腺肿瘤上做了案例研究.结果,模型预测得分最高的前30个疾病关联miRNA中28个得到了证实.这些优异的结果表明,该算法是一种有效预测miRNA-疾病关系的工具,能够为生物实验提供高可靠的疾病关联miRNA候选物.
CSCD记录号	CSCD:6770137
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.xjipc.cas.cn/handle/365002/7353]
专题	新疆理化技术研究所_多语种信息技术研究室
作者单位	1.枣庄学院外国语学院 2.江西理工大学信息工程学院 3.中国科学院新疆理化技术研究所 4.枣庄学院信息科学与工程学院
推荐引用方式 GB/T 7714	王磊,徐涛,宋传东,等. 基于深度学习的miRNA与疾病相关性预测算法[J]. 电子学报,2020,48(5):870-877.
APA	王磊.,徐涛.,宋传东.,王海峰.,尤著宏.,...&闫欣.(2020).基于深度学习的miRNA与疾病相关性预测算法.电子学报,48(5),870-877.
MLA	王磊,et al."基于深度学习的miRNA与疾病相关性预测算法".电子学报 48.5(2020):870-877.