病毒3CL蛋白酶三维结构模型及其抑制剂的虚拟筛选(英文)

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	病毒3CL蛋白酶三维结构模型及其抑制剂的虚拟筛选(英文)
	熊斌 ; 桂春山 ; 徐小英 ; 罗成3 ; 陈静2 ; 罗海彬 ; 陈莉莉4 ; 李国伟 ; 孙涛 ; 余长缨
刊名	Acta Pharmacologica Sinica
	2003-06-30
期号	06 页码:10
关键词	非典型肺炎(SARS) 3CL蛋白酶抑制剂分子模拟虚拟筛选生物信息学
文献子类	Article
英文摘要	目的:构建SARS病毒类3C(3CL)蛋白酶的三维结构模型,根据这一模型设计3CL蛋白酶的抑制剂。方法:用生物信息学方法从GenBank和PDB库中搜寻出具有晶体结构并与SARS病毒3CL蛋白酶有较高同源型的蛋白质,以此为模板,用同源蛋白模建方法构建SARS病毒3CL蛋白酶的三维结构模型;针对模建的三维结构模型,进行高通量虚拟筛选,从现有小分子数据库中获得具有抑制SARS病毒3CL蛋白酶活性的化合物。结果:同源性分析表明SARS病毒3CL蛋白酶与遗传性肠胃炎主蛋白酶(TGEV M~(pro)),有较高的同源性,组成底物结合口袋残基的同源性更高。因此,可以根据TGEV M~(pro)的晶体结构为模板模建SARS病毒3CL蛋白酶的三维结构。三维结构模型表明,ARS病毒3CL蛋白酶的结构与TGEV M~(pro)的结构非常相象,两个蛋白酶活性口袋的结构和形状儿乎一样。虚拟筛选测试研究表明,MRRD数据库中的73个蛋白酶抑制剂能与两个蛋白同时作用。结论:无论是SARS病毒3CL蛋白酶还是TGEV M~(pro)的晶体结构均可以作为设计抗SARS药物的结构模型。从现有的蛋白酶抑制剂中筛选抗SARS药物可能是一条好的途径。
资助项目	Project the 863 Hi-Tech Program, (No 2001AA235051, 2001AA235071 and 2001AA231111), the National Natural Science Foundation of China, (No 29725203, 20072042), the State Key Program of Basic Research of China,[No] ; Project the 863 Hi-Tech Program, (No 2001AA235051, 2001AA235071 and 2001AA231111), the National Natural Science Foundation of China, (No 29725203, 20072042), the State Key Program of Basic Research of China,[002CB512801] ; Project the 863 Hi-Tech Program, (No 2001AA235051, 2001AA235071 and 2001AA231111), the National Natural Science Foundation of China, (No 29725203, 20072042), the State Key Program of Basic Research of China,[002CB512802]
语种	英语
内容类型	期刊论文
源URL	[http://119.78.100.183/handle/2S10ELR8/270221]
专题	药物发现与设计中心药物化学研究室生物技术药物研发中心（筹）药理学第三研究室药物安全性评价中心
作者单位	1.中国科学院上海药物研究所,药物化学研究室,上海 201203, 中国. 2.中国科学院上海药物研究所,药物安全性评价中心,上海 201203, 中国.; 3.中国科学院上海药物研究所,药物发现与设计中心,上海 201203, 中国.; 4.中国科学院上海药物研究所,生物技术药物研发中心(筹),上海 201203, 中国.;
推荐引用方式 GB/T 7714	熊斌,桂春山,徐小英,等. 病毒3CL蛋白酶三维结构模型及其抑制剂的虚拟筛选(英文)[J]. Acta Pharmacologica Sinica,2003(06):10.
APA	熊斌.,桂春山.,徐小英.,罗成.,陈静.,...&蒋华良.(2003).病毒3CL蛋白酶三维结构模型及其抑制剂的虚拟筛选(英文).Acta Pharmacologica Sinica(06),10.
MLA	熊斌,et al."病毒3CL蛋白酶三维结构模型及其抑制剂的虚拟筛选(英文)".Acta Pharmacologica Sinica .06(2003):10.