一种考虑蛋白质柔性的分子对接方法

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	一种考虑蛋白质柔性的分子对接方法
	康玲; 李洪林; 王希诚
刊名	大连理工大学学报
	2008-03-15
期号	02 页码:282-286
关键词	分子对接蛋白质柔性残基基团优化模型
文献子类	Article
英文摘要	分子对接是计算机辅助药物分子优化设计中的一种重要方法,为此建立了基于诱导契合的分子对接优化模型.模型中引入残基基团的概念,将蛋白质划分成若干个残基基团,通过这些残基基团的运动近似表征整个蛋白质的运动情况,并将配体小分子的运动处理为平移、转动和柔性键旋转三部分分量.设计了一个将k-均值聚类和遗传算法相结合的快速迭代格式,并采用多种群遗传策略和信息熵控制的空间减缩搜索技术加速了分子对接设计中的遗传演化进程.在此基础上,开发了一种考虑蛋白质柔性的对接程序FlexGAsDock.数值试验表明,该程序较好地平衡了效率与精度之间的关系,取得了满意的对接结果.
资助项目	国家自然科学基金资助项目[10572033] ; 国家“九七三”重点基础研究发展规划资助项目[2004CB518901] ; 国家“八六三”科技计划课题资助项目[2006AA01A124]
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://119.78.100.183/handle/2S10ELR8/269956]
专题	药物发现与设计中心
推荐引用方式 GB/T 7714	康玲,李洪林,王希诚. 一种考虑蛋白质柔性的分子对接方法[J]. 大连理工大学学报,2008(02):282-286.
APA	康玲,李洪林,&王希诚.(2008).一种考虑蛋白质柔性的分子对接方法.大连理工大学学报(02),282-286.
MLA	康玲,et al."一种考虑蛋白质柔性的分子对接方法".大连理工大学学报 .02(2008):282-286.