植物胆碱单氧化酶的生物信息学分析 | |
冯潜 ; 弄庆媛 ; 麦秀英 ; 周虹 ; 陈劲松 ; 周嘉裕 ; 廖海 | |
刊名 | 中国农学通报 |
2012 | |
卷号 | 28期号:24页码:194-200 |
关键词 | 生物信息学 胆碱单氧化酶 GenBank 抗逆 |
ISSN号 | 1000-6850 |
其他题名 | Bioinformatics Analysis of Choline Monooxygenase in Plants |
通讯作者 | 周嘉裕 |
中文摘要 | 为了研究胆碱单氧化物酶的抗逆机理,运用NCBI、Expasy、Psort、NetPhosK、TMHMM、NPSA网站和MEGA5、DNAman软件,对已在GenBank数据库中注册中的甜菜、菠菜、四翅滨藜草、山菠菜、苋菜等植物胆碱单氧化酶的氨基酸序列进行生物信息学分析。结果表明:植物胆碱单氧化酶中Ala、Ser、Leu等氨基酸含量较丰富,属于稳定蛋白;不同植物胆碱单氧化酶的氨基酸序列具有较高的同源性(81.52%),均含有转运肽区、2Fe-S中心区和非血红素Fe离子结合区;分子进化树揭示胆碱单氧化酶有较强的保守性,可作为植物遗传分化和分子进化研究的重要依据;分子中不存在跨膜结构域,与疏水区域预测结果一致;可能受蛋白激酶C磷酸化,位点为Ser326;无规卷曲是多肽链中大量的结构元件;包含2个功能结构域,分属于Rieske家族与SRPBCC家族。本研究结果为开展胆碱单氧化酶的酶学特性及甘氨酸甜菜碱生物合成的分子机理研究提供理论参考。 更多还原 |
学科主题 | 生态研究 |
语种 | 中文 |
公开日期 | 2013-07-03 |
内容类型 | 期刊论文 |
源URL | [http://210.75.237.14/handle/351003/23867] |
专题 | 成都生物研究所_生态研究 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 冯潜,弄庆媛,麦秀英,等. 植物胆碱单氧化酶的生物信息学分析[J]. 中国农学通报,2012,28(24):194-200. |
APA | 冯潜.,弄庆媛.,麦秀英.,周虹.,陈劲松.,...&廖海.(2012).植物胆碱单氧化酶的生物信息学分析.中国农学通报,28(24),194-200. |
MLA | 冯潜,et al."植物胆碱单氧化酶的生物信息学分析".中国农学通报 28.24(2012):194-200. |
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