海洋弧菌(Vibrio sp. QD-5)褐藻胶裂解酶基因的克隆和生物信息学分析 | |
晁雅熙; 王淑艳; 吴谡琦; 陈颢 | |
刊名 | 海洋科学进展
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2018-04-15 | |
卷号 | 36期号:02页码:290-300 |
关键词 | Vibrio sp. 褐藻胶裂解酶 基因克隆 生物信息学分析 |
英文摘要 | 以海洋弧菌(Vibrio sp.QD-5)的基因组为模板,使用设计的褐藻胶裂解酶引物进行PCR扩增。将目的基因克隆至pet-22b(+)载体后进行测序。测序结果显示,基因aly-Ⅱ的大小为2 170bp,预测编码含有723个氨基酸的蛋白质。对该蛋白质进一步进行了生物信息学分析。利用ProtParam和ProtScale对蛋白质的理化性质进行分析,结果表明,蛋白质Aly-Ⅱ的理论分子质量为85.6kDa,理论等电点为5.1,并且是一种亲水性蛋白。利用软件MEG 6.0对蛋白质Aly-Ⅱ进行系统发育分析,结果显示,蛋白质Aly-Ⅱ很可能是PL-17家族的褐藻胶裂解酶。利用同源建模法构建蛋白质Aly-Ⅱ的三维结构,Aly-Ⅱ含有2个结构域,分别为(α/α)6toroid结构域和β-sheet结构域。 |
语种 | 中文 |
内容类型 | 期刊论文 |
源URL | [http://ir.fio.com.cn:8080/handle/2SI8HI0U/7276] ![]() |
专题 | 业务部门_海洋生态研究中心 |
作者单位 | 国家海洋局第一海洋研究所 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 晁雅熙,王淑艳,吴谡琦,等. 海洋弧菌(Vibrio sp. QD-5)褐藻胶裂解酶基因的克隆和生物信息学分析[J]. 海洋科学进展,2018,36(02):290-300. |
APA | 晁雅熙,王淑艳,吴谡琦,&陈颢.(2018).海洋弧菌(Vibrio sp. QD-5)褐藻胶裂解酶基因的克隆和生物信息学分析.海洋科学进展,36(02),290-300. |
MLA | 晁雅熙,et al."海洋弧菌(Vibrio sp. QD-5)褐藻胶裂解酶基因的克隆和生物信息学分析".海洋科学进展 36.02(2018):290-300. |
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