南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L RNA解旋酶CiDDX5的基因特征及其表达分析

	南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L RNA解旋酶CiDDX5的基因特征及其表达分析
	宓妍妍 1; 王燕 1; 黄晓航 2; 刘晨临 2
刊名	海洋科学进展
	2013
卷号	31 期号:4 页码:566-573
关键词	南极冰藻 Chlamydomonas sp.ICE-L DEAD-box RNA解旋酶低温、高盐胁迫适应 Antarctic ice algae Chlamydomonas sp.ICE-L DEAD-box RNA helicase Abiotic stress adaptation
ISSN号	1671-6647
英文摘要	DEAD-box RNA解旋酶能介导NTP依赖的双链RNA解旋,大量的研究表明其在植物的各种非生物胁迫的适应过程中发挥着重要作用。本研究从严格嗜冷的南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L的EST序列中筛选并克隆得到了DEAD-box RNA解旋酶CiDDX5的全长基因,利用生物信息学软件对该基因编码的蛋白序列进行了研究,并通过实时定量PCR研究了在低温、高盐胁迫下CiDDX5基因表达量的变化。研究结果显示,DEAD-box RNA解旋酶CiDDX5基因的编码区长2 077bp,编码513个氨基酸。在以氨基酸序列构建的系统进化树中,Ci-DDX5序列和其他绿藻类的聚在一起,与莱茵衣藻,团藻和胶球藻的蛋白序列同源性依次分别为65%,64%和63%。实时定量PCR研究结果表明,在低温和高盐胁迫下,CiDDX5基因的表达量都有一定程度的提高,提示该基因的功能与南极衣藻适应低温、高盐的海冰环境的特性相关。
资助项目	国家自然科学基金项目RNA解旋酶在南极海冰衣藻冰冻环境适应中的作用机制
WOS研究方向	Environmental Sciences & Ecology
语种	中文
CSCD记录号	CSCD:5039597
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.fio.com.cn:8080/handle/2SI8HI0U/28536]
专题	自然资源部第一海洋研究所
作者单位	1.山东轻工业学院食品与生物工程学院, 济南, 山东 250353, 中国 2.山东轻工业学院食品与生物工程学院, 济南, 山东 250353, 中国 3.国家海洋局第一海洋研究所, 青岛, 山东 266061, 中国 4.国家海洋局第一海洋研究所, 青岛, 山东 266061, 中国
推荐引用方式 GB/T 7714	宓妍妍,王燕,黄晓航,等. 南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L RNA解旋酶CiDDX5的基因特征及其表达分析[J]. 海洋科学进展,2013,31(4):566-573.
APA	宓妍妍,王燕,黄晓航,&刘晨临.(2013).南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L RNA解旋酶CiDDX5的基因特征及其表达分析.海洋科学进展,31(4),566-573.
MLA	宓妍妍,et al."南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L RNA解旋酶CiDDX5的基因特征及其表达分析".海洋科学进展 31.4(2013):566-573.