南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L RNA解旋酶CiDDX5的基因特征及其表达分析 | |
宓妍妍1; 王燕1; 黄晓航2; 刘晨临2 | |
刊名 | 海洋科学进展
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2013 | |
卷号 | 31期号:4页码:566-573 |
关键词 | 南极冰藻 Chlamydomonas sp.ICE-L DEAD-box RNA解旋酶 低温、高盐胁迫适应 Antarctic ice algae Chlamydomonas sp.ICE-L DEAD-box RNA helicase Abiotic stress adaptation |
ISSN号 | 1671-6647 |
英文摘要 | DEAD-box RNA解旋酶能介导NTP依赖的双链RNA解旋,大量的研究表明其在植物的各种非生物胁迫的适应过程中发挥着重要作用。本研究从严格嗜冷的南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L的EST序列中筛选并克隆得到了DEAD-box RNA解旋酶CiDDX5的全长基因,利用生物信息学软件对该基因编码的蛋白序列进行了研究,并通过实时定量PCR研究了在低温、高盐胁迫下CiDDX5基因表达量的变化。研究结果显示,DEAD-box RNA解旋酶CiDDX5基因的编码区长2 077bp,编码513个氨基酸。在以氨基酸序列构建的系统进化树中,Ci-DDX5序列和其他绿藻类的聚在一起,与莱茵衣藻,团藻和胶球藻的蛋白序列同源性依次分别为65%,64%和63%。实时定量PCR研究结果表明,在低温和高盐胁迫下,CiDDX5基因的表达量都有一定程度的提高,提示该基因的功能与南极衣藻适应低温、高盐的海冰环境的特性相关。 |
资助项目 | 国家自然科学基金项目RNA解旋酶在南极海冰衣藻冰冻环境适应中的作用机制 |
WOS研究方向 | Environmental Sciences & Ecology |
语种 | 中文 |
CSCD记录号 | CSCD:5039597 |
内容类型 | 期刊论文 |
源URL | [http://ir.fio.com.cn/handle/2SI8HI0U/6338] ![]() |
专题 | 自然资源部第一海洋研究所 |
作者单位 | 1.山东轻工业学院食品与生物工程学院, 济南, 山东 250353, 中国 2.山东轻工业学院食品与生物工程学院, 济南, 山东 250353, 中国 3.国家海洋局第一海洋研究所, 青岛, 山东 266061, 中国 4.国家海洋局第一海洋研究所, 青岛, 山东 266061, 中国 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 宓妍妍,王燕,黄晓航,等. 南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L RNA解旋酶CiDDX5的基因特征及其表达分析[J]. 海洋科学进展,2013,31(4):566-573. |
APA | 宓妍妍,王燕,黄晓航,&刘晨临.(2013).南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L RNA解旋酶CiDDX5的基因特征及其表达分析.海洋科学进展,31(4),566-573. |
MLA | 宓妍妍,et al."南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L RNA解旋酶CiDDX5的基因特征及其表达分析".海洋科学进展 31.4(2013):566-573. |
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