基于分子标记的宏基因组16S rRNA基因高变区选择策略; Strategy of selecting 16S rRNA hypervariable regions for matagenome-phylogenetic marker genes based analysis | |
张军毅 ; 朱冰川 ; 徐超 ; 丁啸 ; 李俊锋 ; 张学工 ; 陆祖宏 | |
刊名 | 应用生态学报
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2015 | |
关键词 | 微生物多样性 新一代测序技术 选择策略 16S rRNA microbial diversity 16S rRNA next generation sequencing (NGS) selection strategy |
英文摘要 | 随着新一代DNA测序技术出现,人们能够同时对多个DNA样本的宏基因组进行并行分析,尤其是以16S rRNA基因高变区为分子标记的测序已经成为微生物多样性研究最为简洁有效的方法.目前二代高通量测序的读长不能覆盖16S rRNA基因的全长,需要选择一个有效的高变区进行测序.十多年来,对于16S rRNA基因高变区的选择策略没有统一的标准.本文分析了常用的高变区选择策略,指出不同环境条件是影响高变区选择的重要因素之一.在此基础上,提出了高变区选择的参考准则,同时建议应对选择的高变区进行有效评估.; 中文核心期刊要目总览(PKU); 中国科技核心期刊(ISTIC); 11; 3545-3553; 26 |
语种 | 中文 |
内容类型 | 期刊论文 |
源URL | [http://ir.pku.edu.cn/handle/20.500.11897/432251] ![]() |
专题 | 工学院 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 张军毅,朱冰川,徐超,等. 基于分子标记的宏基因组16S rRNA基因高变区选择策略, Strategy of selecting 16S rRNA hypervariable regions for matagenome-phylogenetic marker genes based analysis[J]. 应用生态学报,2015. |
APA | 张军毅.,朱冰川.,徐超.,丁啸.,李俊锋.,...&陆祖宏.(2015).基于分子标记的宏基因组16S rRNA基因高变区选择策略.应用生态学报. |
MLA | 张军毅,et al."基于分子标记的宏基因组16S rRNA基因高变区选择策略".应用生态学报 (2015). |
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