H5N2亚型禽流感病毒血凝素裂解位点碱性氨基酸对应mRNA核苷酸的二级结构分析; Secondary structural analysis of the mRNA regions encoding the hemagglutinin cleavage site basic amino acids of the avian influenza virus H5N2 subtype samples | |
张素霞 ; 王建新 ; 刘次全 | |
刊名 | 生物信息学
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2009 | |
关键词 | 禽流感 血凝素 裂解位点 mRNA二级结构 动态折叠 |
DOI | 10.3969/j.issn.1672-5565.2009.02.019 |
英文摘要 | 以H5N2亚型禽流感病毒毒株血凝素蛋白裂解位点碱性氨基酸为研究对象,对其密码子偏好性和对应mRNA序列的折叠二级结构特点进行研究和分析.旨在探讨裂解位点氨基酸对应mRNA核苷酸片段的二级结构与病毒致病力的关系,希望能对禽流感病毒的研究提供一些基础性信息.将mRNA样本按照序列等步长递增的方法,用RNAstructure 4.1程序预测这些样本的动态延伸折叠二级结构.序列和结构的分析结果:裂解位点的碱性氨基酸对富含腺嘌呤的密码子有强烈偏好;与碱性氨基酸对应的mRNA片段上的核苷酸主要位于折叠二级结构的单链环区,少数位于配对螺旋区.结果表明:裂解位点氨基酸对应的mRNA核苷酸形成发夹端环的大小与其碱性氨基酸的多少具有正相关性.; 国家自然科学基金; 中国科学院知识创新工程前沿交叉项目; 中国科技核心期刊(ISTIC); 中国科学引文数据库(CSCD); 0; 2; 155-158; 7 |
语种 | 中文 |
内容类型 | 期刊论文 |
源URL | [http://ir.pku.edu.cn/handle/20.500.11897/241021] ![]() |
专题 | 生命科学学院 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 张素霞,王建新,刘次全. H5N2亚型禽流感病毒血凝素裂解位点碱性氨基酸对应mRNA核苷酸的二级结构分析, Secondary structural analysis of the mRNA regions encoding the hemagglutinin cleavage site basic amino acids of the avian influenza virus H5N2 subtype samples[J]. 生物信息学,2009. |
APA | 张素霞,王建新,&刘次全.(2009).H5N2亚型禽流感病毒血凝素裂解位点碱性氨基酸对应mRNA核苷酸的二级结构分析.生物信息学. |
MLA | 张素霞,et al."H5N2亚型禽流感病毒血凝素裂解位点碱性氨基酸对应mRNA核苷酸的二级结构分析".生物信息学 (2009). |
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