SARS冠状病毒全基因组序列初步分析

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	SARS冠状病毒全基因组序列初步分析; Initial Analysis of Complete Genome Sequences of SARS Coronavirus
	陈蕴佳 ; 高歌 ; 鲍一明 ; 吴健民 ; 蔡涛 ; 叶志强 ; 顾孝诚 ; 罗静初 ; Rodrigo LOPEZ
刊名	遗传学报
	2003
关键词	SARS冠状病毒多序列比对蛋白质序列分析生物信息学
英文摘要	对已经完成全序列测定的12个SARS病毒基因组进行了多序列比对,发现序列主体部分29708 b具有99.82%的相同碱基,除2个序列各有5个和6个碱基的缺失外,其余部分共有42个位点核苷酸碱基的差异,其中28个位点的碱基差异可引起氨基酸残基改变.利用蛋白质二级结构和跨膜螺旋预测以及蛋白质定位等生物信息学工具,分析了这些产生氨基酸改变部位的蛋白质构像,推测了可能产生的结构和功能改变,为进一步生物学实验提供参考.所有分析结果同时在北京大学生物信息中心抗SARS网站(antisars.cbi.pku.edu.cn)上发布.; Multiple sequence alignment among 12 complete SARS coronavirus (SARS-CoV) sequences reveals that the major parts of 29708 b of the genomes have 99.82% identical bases. Forty two nucleotide mismatches were found in addition to the five and six gaps in two genomes. Among them, 28 mismatches result in changes of amino acid in the encoded proteins. Analysis of the changes implies possible effect on the Spike and Membrane protein of the virus, while most of the other changes seem not very significant to alter the structure and function of the proteins. These results have been released on the anti-sars web site maintained by the Centre of Bioinformatics, Peking University (antisars.cbi.pku.edu.cn) and may be of help for further experimental study.; 国家高技术研究发展计划(863计划); 国家自然科学基金; PubMed; 中文核心期刊要目总览(PKU); 中国科学引文数据库(CSCD); 0; 6; 493-500; 30
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.pku.edu.cn/handle/20.500.11897/231587]
专题	生命科学学院
推荐引用方式 GB/T 7714	陈蕴佳,高歌,鲍一明,等. SARS冠状病毒全基因组序列初步分析, Initial Analysis of Complete Genome Sequences of SARS Coronavirus[J]. 遗传学报,2003.
APA	陈蕴佳.,高歌.,鲍一明.,吴健民.,蔡涛.,...&Rodrigo LOPEZ.(2003).SARS冠状病毒全基因组序列初步分析.遗传学报.
MLA	陈蕴佳,et al."SARS冠状病毒全基因组序列初步分析".遗传学报 (2003).