11种结合自由能评价函数对中草药中法尼酯受体的配体预测比较; Comparative studies of prediction of herb-based FXR ligands by 11 binding free energies scoring fuctions | |
朱伟 ; 黄钦 ; 李旭东 ; 陈可冀 ; 徐筱杰 | |
刊名 | 计算机与应用化学 |
2007 | |
关键词 | 结合自由能 分子对接 评价函数 法尼酯受体 中草药 |
DOI | 10.3969/j.issn.1001-4160.2007.01.019 |
英文摘要 | 以蛋白质晶体结构数据库PDB中FXR-fexaramine复合物(PDB代码:1OSH)三维结构为研究对象,采用Ligandfit作为采样工具,筛选到中草药中12个可能与FXR相互作用强的的配体.并比较了11种结合自由能评价函数(Ligscorel、Ligscore2、D-Score、-PLP1、-PLP2、Jain、-PMF、Ludi1、Ludi2、Ludi3,以及共同评价函数)在该研究体系中的预测能力.结果表明将评价函数中的-PLP1和-PLP1这2种评价函数的预测能力最好.; 中文核心期刊要目总览(PKU); 中国科技核心期刊(ISTIC); 中国科学引文数据库(CSCD); 0; 1; 94-96; 24 |
语种 | 中文 |
内容类型 | 期刊论文 |
源URL | [http://ir.pku.edu.cn/handle/20.500.11897/289280] |
专题 | 化学与分子工程学院 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 朱伟,黄钦,李旭东,等. 11种结合自由能评价函数对中草药中法尼酯受体的配体预测比较, Comparative studies of prediction of herb-based FXR ligands by 11 binding free energies scoring fuctions[J]. 计算机与应用化学,2007. |
APA | 朱伟,黄钦,李旭东,陈可冀,&徐筱杰.(2007).11种结合自由能评价函数对中草药中法尼酯受体的配体预测比较.计算机与应用化学. |
MLA | 朱伟,et al."11种结合自由能评价函数对中草药中法尼酯受体的配体预测比较".计算机与应用化学 (2007). |
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