利用PLS-VIP方法筛选差异表达基因; Searching for Differentially Expressed Genes by PLS-VIP Method | |
韩放 ; 吴晶辰 ; 徐江峰 ; 邓明华 | |
2009 | |
关键词 | 微阵列 差异表达基因 降维 PLS-VIP microarray differentially expressed genes reduction of dimension PLS-VIP |
英文摘要 | 提出一种基于变量权重寻找差异表达基因的新方法.该方法的最终目的是从微阵列数据中抽取出核心变量(基因).将该种方法抽取出的差异表达基因判别样本的能力和普通的PLS方法以及判别最小二乘方法进行比较,结果表明该方法的错误率明显低于其他两种传统方法.因此,PLS-VIP方法是一种较为合适的抽取差异表达基因并判别样本的方法.; A new approach called PLS-VIP based on variables' importance of projection (VIP) for detecting differentially expressed genes is proposed. It is a new method to sum up the contribution of components based on Partial Least Square method (PLS). As it takes the correlation of different genes into consideration, it is more suitable than those classification methods based on reviewing distinct genes separately. The effect of genes extracted by ordinary PLS, discriminant PLS and proposed method to classify multi-class tumors is compared. Results show that the error rate of the new method is obviously lower than the other two methods in most cases.; 北京大学校长基金; 国家自然科学基金; 国家高技术研究发展计划(863计划); 国家重点基础研究发展规划(973计划); 微软亚洲研究院资助项目; 中文核心期刊要目总览(PKU); 中国科技核心期刊(ISTIC); 中国科学引文数据库(CSCD); 0; 1; 1-5; 45 |
语种 | 中文 |
出处 | 万方 ; http://d.g.wanfangdata.com.cn/Periodical_bjdxxb200901001.aspx |
出版者 | 北京大学学报 自然科学版 |
内容类型 | 其他 |
源URL | [http://hdl.handle.net/20.500.11897/13725] |
专题 | 数学科学学院 生命科学学院 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 韩放,吴晶辰,徐江峰,等. 利用PLS-VIP方法筛选差异表达基因, Searching for Differentially Expressed Genes by PLS-VIP Method. 2009-01-01. |
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