题名 | 栉孔扇贝C型凝集素-2(CfLec-2)基因的克隆和分析 |
作者 | 郑沛林 |
答辩日期 | 2008-06-10 |
文献子类 | 硕士 |
授予单位 | 中国科学院海洋研究所 |
授予地点 | 海洋研究所 |
导师 | 宋林生 |
关键词 | 栉孔扇贝 C-型凝集素 天然免疫 重组表达 抗菌活性 凝菌活性 免疫识别 |
学位专业 | 海洋生物学 |
英文摘要 | 栉孔扇贝是我国北方一种重要的贝类养殖品种。自1997年以来爆发的栉孔扇贝大规模死亡,给地区经济造成了重大损失并且已经严重威胁着扇贝养殖业的健康发展。然而,到目前为止,对扇贝免疫防御分子机理的了解还很少,深入研究扇贝免疫应答的分子机制是认识和了解病害发生和实现病害控制的重要途径。本研究采用了EST大规模测序和3’RACE的方法,从栉孔扇贝cDNA文库中克隆到一个凝集素基因CfLec-2,并对功能进行了研究。 CfLec-2 cDNA全长708bp,5’非翻译区(Untranslated Region, UTR)含有59bp,3’非翻译区含有163bp,具有典型的多聚腺苷酸加尾信号序列AATAAA和多聚腺苷酸尾巴,开放阅读框(Open Reading Frame, ORF )含有486bp,编码162个氨基酸残基,该多肽的理论分子量为16.8 kDa,等电点为4.54。利用SignalP分析,发现其信号肽的剪切位置在VEA-QSL之间。经BLASTP比对分析可知,CfLec-2基因编码的蛋白与人的Brevican,Anguilla japonica的C-type lectin-1和C-type lectin-2, Rattus norvegicus的CD23有较高的相似性,其中与Brevican的一致性有37%。Clustal W多序列比对发现该多肽具有标准长型C型凝集素所必须的6个保守半胱氨酸和相对保守的糖识别位点。用SMART(Small Modular Architecture Research Tool)软件分析发现其具有一个保守的糖识别结构域(Carbohydrate-recognition Domain, CRD),氨基酸序列上第49、125、141、149位置上的半胱氨酸参与形成糖识别结构域,而位于N末端的第21和32位上的两个半胱胺酸形成额外的一个二硫键,位于115、116和117上的Glu、Pro、Asp则构成了糖识别位点。 将编码CfLec-2成熟肽段的cDNA序列克隆进pET32a(+)载体中,并在大肠杆菌Rosetta-gami(DE3)中重组表达CfLec-2。重组蛋白利用其具有的His tag纯化并复性后发现CfLec-2可以凝集溶血葡萄球菌,且凝集过程不需要钙离子的参与。并且,CfLec-2对大肠杆菌TOP10F’有微弱的抑菌活性,对溶壁微球菌、溶血葡萄球菌和鳗弧菌则没有抑菌活性。这一结果说明,CfLec-2可能不仅参与对入侵微生物的识别过程,而且可能作为效应分子起到了直接杀灭入侵微生物的作用。 本研究发现CfLec-2具有和以前在栉孔扇贝报道的CFLec-1完全不同的功 能,说明栉孔扇贝利用不同的凝集素来识别不同的病原,同时也暗示栉孔扇贝中可能有更多不同功能的凝集素有待发现。研究结果丰富和发展了海水无脊椎动物免疫学的内容,对进一步了解扇贝固有免疫的机制,实现养殖扇贝疾病防治具有重要参考价值。 |
语种 | 中文 |
公开日期 | 2010-11-04 |
页码 | 71 |
内容类型 | 学位论文 |
源URL | [http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/284] |
专题 | 海洋研究所_海洋环流与波动重点实验室 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 郑沛林. 栉孔扇贝C型凝集素-2(CfLec-2)基因的克隆和分析[D]. 海洋研究所. 中国科学院海洋研究所. 2008. |
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