题名 | 草鱼(Ctenopharyngodon idella)细菌人工染色体(BAC)文库的构建及其特征分析 |
作者 | 刘航 |
学位类别 | 硕士 |
答辩日期 | 2008-06-16 |
授予单位 | 中国科学院水生生物研究所 |
授予地点 | 水生生物研究所 |
导师 | 朱作言 |
关键词 | 草鱼(Ctenopharyngodon idella) BAC 文库 高密度尼龙膜 |
其他题名 | Construction and characterization of two BAC libraries for grass carp (Ctenopharyngodon idella) |
中文摘要 | 本研究分别用pCC1BAC/EcoRI 和pCC1BAC/HindIII 载体首次构建了两个草鱼(Ctenopharyngodon idella)基因组细菌人工染色体(BAC)文库。EcoRI 文库含有53000 个克隆。随机挑取150 个BAC 克隆NotI 酶酶切结果表明:插入片段为20kb~265kb,平均插入片段长度为139.7kb,空载率为2 %,插入片段大于100kb的克隆所占的比率为84%。草鱼单倍体基因组的大小约为1000Mb,因此本文库的覆盖率达到草鱼基因组的7.4 倍。从该文库中找到任意单拷贝基因序列的概率为99.94%。HindIII 文库含有52216 个克隆,空载率2.8 %,插入片段平均长度为121.5kb。覆盖率达到草鱼基因组的6.3 倍。以4×2 的阵式将所有文库克隆制成高密度尼龙膜。每张尼龙膜分别对应于4 个384 孔板。该文库可用于草鱼重要经济性状基因克隆、分子标记开发、物理图谱构建、比较基因组研究和全基因组测序奠定基础,并将为草鱼和其它鲤科养殖鱼类的遗传改良提供理论依据和技术支撑。 |
语种 | 中文 |
公开日期 | 2010-11-16 |
页码 | 57 |
内容类型 | 学位论文 |
源URL | [http://ir.ihb.ac.cn/handle/342005/12348] |
专题 | 水生生物研究所_中科院水生所知识产出(2009年前)_学位论文 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 刘航. 草鱼(Ctenopharyngodon idella)细菌人工染色体(BAC)文库的构建及其特征分析[D]. 水生生物研究所. 中国科学院水生生物研究所. 2008. |
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