鲤est-Ssr标记的开发及跨种扩增研究

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	鲤est-Ssr标记的开发及跨种扩增研究
	王丹 ; 廖小林 ; 俞小牧 ; 程磊 ; 王春艳 ; 游翠红 ; 童金苟
	2007
中文摘要	本研究主要运用生物信息学方法,结合适当的分子生物学和遗传学实验验证, 进行筛选开发鲤Est数据库中的微卫星标记(est-ssr)以及在近缘种类中的扩增研究。在1万余条鲤est中序列中,共发现ssr 555个(5．5％),其中二碱基和三碱基重复次数最多,在所有含ssr序列的鲤est数据库中分别占37．18％和30．81％。根据筛选得到的est-ssr序列,初步设计合成了60对est-ssr引物,在鲤、鲫和链中的多态性分别是42％、18％和5％。25个est-ssr位点在洞庭湖鲤鱼群体中的观测杂合度为0．13-1．00, 期望杂合度0．12-0．91,平均等位基因数7个;其中,19个est-ssr位点符合哈迪- 温伯格平衡(hwe),6个位点偏离hwe平衡。这些研究结果表明,本研究所开发的est-ssr 标记适合群体遗传学和比较基因组作图的研究。
会议录	2006年度学术研讨会论文摘要汇编
语种	中文
内容类型	会议论文
源URL	[http://ir.ihb.ac.cn/handle/342005/14768]
专题	水生生物研究所_中科院水生所知识产出（2009年前）_会议论文
推荐引用方式 GB/T 7714	王丹,廖小林,俞小牧,等. 鲤est-Ssr标记的开发及跨种扩增研究[C]. 见:.