5科11种鱼类ITS1特征分析及其在系统分类研究中的适用性

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	5科11种鱼类ITS1特征分析及其在系统分类研究中的适用性
	武宝生; 司李真; 孔晓瑜; 时伟; 杨敏
刊名	水产学报
	2018
卷号	42 期号:04 页码:465-475
关键词	鲈形目鲹科 ITS1序列多态性系统演化假基因
通讯作者	武宝生
中文摘要	为了探讨ITS1作为分子标记用于鱼类系统演化的适用性,实验选取鲈形目5科11种鱼类为研究对象,包括尖吻鲈科、射水鱼科、军曹鱼科、剑鱼科和鲹科。通过克隆和测序等技术共获得了348条ITS1序列,长度范围为442~661 bp;通过对所有序列的长度、变异位点数量、GC含量、核苷酸多样性及单倍型多样性指数等遗传特征比较分析发现,11种鱼类ITS1序列无论是在种内还是在种间,长度和序列都表现出较为明显的多态性。特别是在军曹鱼中,70条克隆的长度范围为648~661 bp,但有一条序列存在55 bp缺失,结合该序列的GC含量,二级结构和最小自由能,推断该序列为假基因。以鮣为外类群,基于核糖体ITS1序列构建的邻接树显示在物种种类水平上,不同个体的克隆都按种类聚支,ITS1可以用于该类群物种的区分;在属级水平上,ITS1将11属鱼类完全区分开,能够用于属级水平的区分;在科级水平上,虽然鲹科分为2支的分子结果和形态分类存在差异,但ITS1构建的系统关系与线粒体分子标记构建的系统进化树相似。研究表明,核糖体ITS1可以作为一种有效的分子标记用于研究鱼类的系统分类研究,并且不同的分类阶元其解析能力不同,这将为鱼类核糖体的研究提供科学依据。
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.scsio.ac.cn/handle/344004/17287]
专题	南海海洋研究所_中科院海洋生物资源可持续利用重点实验室
推荐引用方式 GB/T 7714	武宝生,司李真,孔晓瑜,等. 5科11种鱼类ITS1特征分析及其在系统分类研究中的适用性[J]. 水产学报,2018,42(04):465-475.
APA	武宝生,司李真,孔晓瑜,时伟,&杨敏.(2018).5科11种鱼类ITS1特征分析及其在系统分类研究中的适用性.水产学报,42(04),465-475.
MLA	武宝生,et al."5科11种鱼类ITS1特征分析及其在系统分类研究中的适用性".水产学报 42.04(2018):465-475.