蒺藜苜蓿全基因组中U-box基因家族的筛选与特征分析

doi:10.11686/cyxb2015102

CORC > 中国农业科学院 > 北京畜牧兽医研究所

	蒺藜苜蓿全基因组中U-box基因家族的筛选与特征分析
	郑兴卫; 邵麟惠; 李聪
刊名	草业学报
	2015
卷号	24 期号:8 页码:130-141
关键词	蒺藜苜蓿 U-box基因家族进化表达模式
ISSN号	1004-5759
DOI	10.11686/cyxb2015102
其他题名	Genome-wide screening and characterization of the U-box gene family in Medicago truncatula
英文摘要	植物基因组中广泛存在U-box基因,其编码蛋白大部分作为泛素系统中决定底物特异性识别的E_3泛素连接酶,广泛地调控植物生长生殖发育以及响应逆境胁迫等过程。本文利用蒺藜苜蓿基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定蒺藜苜蓿U-box家族基因;采用MEGA6软件进行系统进化树分析;通过GSDS在线工具和Mapinspect软件进行基因结构及染色体定位分析;利用已有的蒺藜苜蓿芯片数据进行组织表达和胁迫响应表达分析。结果表明,蒺藜苜蓿基因组中含有41个U-box基因,不均匀地分布于蒺藜苜蓿的8条染色体上。根据结构域组成和系统进化分析将这些U-box蛋白分成6类。基因表达模式分析发现,该家族成员的表达具有一定的组织特异性,并能响应盐、干旱和氮素胁迫。这些研究结果为蒺藜苜蓿U-box基因家族的功能分析奠定了基础。
学科主题	农作物
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.nais.net.cn/handle/2HMLN22E/121555]
专题	北京畜牧兽医研究所
作者单位	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京, 100193
推荐引用方式 GB/T 7714	郑兴卫,邵麟惠,李聪. 蒺藜苜蓿全基因组中U-box基因家族的筛选与特征分析[J]. 草业学报,2015,24(8):130-141.
APA	郑兴卫,邵麟惠,&李聪.(2015).蒺藜苜蓿全基因组中U-box基因家族的筛选与特征分析.草业学报,24(8),130-141.
MLA	郑兴卫,et al."蒺藜苜蓿全基因组中U-box基因家族的筛选与特征分析".草业学报 24.8(2015):130-141.