辣椒转录组SSR挖掘及其多态性分析

	辣椒转录组SSR挖掘及其多态性分析
	刘峰; 王运生; 田雪亮; 茆振川; 邹学校; 谢丙炎
刊名	园艺学报
	2012-01-25
期号	01 页码:168-174
关键词	辣椒转录组 EST-SSR
英文摘要	利用SSR检索程序从两个辣椒转录组共221037条unigenes(97.3Mb)中筛选得到17319个SSR位点(7.83%),其发生频率为1/56kb。其中以单核苷重复基序为主导类型,占总SSR的56.30%;其次是二、三核苷酸重复基序,其出现频率分别为19.16%和23.18%。对所有含SSR位点EST序列设计的10468对引物进行E-PCR多态性检测,获得1538对E-PCR多态性引物。随机选取20对引物进行验证,其中7对(36.84%)在10个不同类型辣椒材料中表现出多态性,PIC值范围为0.33～0.89,平均为0.67,将10个辣椒材料分为3类。这些潜在的多态性EST-SSR的开...
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语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://111.203.20.206/handle/2HMLN22E/99477]
专题	蔬菜花卉研究所_植物保护研究室
作者单位	湖南省农业科学院蔬菜研究所;中国农业科学院蔬菜花卉研究所;湖南农业大学生物安全科学技术学院;河南科技学院
推荐引用方式 GB/T 7714	刘峰,王运生,田雪亮,等. 辣椒转录组SSR挖掘及其多态性分析[J]. 园艺学报,2012(01):168-174.
APA	刘峰,王运生,田雪亮,茆振川,邹学校,&谢丙炎.(2012).辣椒转录组SSR挖掘及其多态性分析.园艺学报(01),168-174.
MLA	刘峰,et al."辣椒转录组SSR挖掘及其多态性分析".园艺学报 .01(2012):168-174.