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甘薯茎线虫β-1,4内切葡聚糖酶基因(Dd-eng-1b)cDNA全长的克隆与序列分析
彭焕; 彭德良; 黄文坤
刊名农业生物技术学报
2009
卷号17期号:6页码:1035-1041
关键词马铃薯腐烂茎线虫 β-1 4-内切葡聚糖酶 GHF5家族
ISSN号1006-1304
其他题名Molecular Cloning and Sequence Analysis of a New β-1,4-endoglucanase Gene(Dd-eng-1b)from Plant-parasitic Nematode Ditylenchus destructor on Sweetpotato in China
英文摘要β-1,4内切葡聚糖酶是植物寄生线虫食道腺分泌的一类细胞壁降解酶,在植物线虫的侵染过程中具有重要的作用.以马铃薯腐烂茎线虫(Ditylenchus destructor)为材料,用RT-PCR和RACE方法,获得了β-1,4-内切葡聚糖酶基因的cDNA全长,并将该基因命名为Dd-eng-1b(GenBank登录号为FJ430142).此cDNA全长序列为1 640 bp,包括1个1 443 bp的完整ORF,编码1含481个氨基酸的蛋白,其理论分子量为50.89 kD,等电点pI为6.94.序列比对分析表明,含有糖基水解酶的保守结构域,属于纤维素酶第五家族成员,N端具有19个氨基酸残基组成的信号肽,C端含有细菌式样的纤维素结合域(CBD Ⅱ).cDNA与基因组DNA重叠分析表明,此基因包含4个内含子,长度分别为36、76、187和344bp,切割点符合5'-GT……AG-3'的规律.系统进化树分析表明,该基因与细菌Bacillus subtilis和Erwina carotovora分泌的纤维素酶属于同一支,推测该基因可能来源于细菌的水平基因转移.
学科主题农业基础科学
语种中文
内容类型期刊论文
源URL[http://ir.nais.net.cn/handle/2HMLN22E/135567]  
专题植物保护研究所_植物病害研究室
作者单位中国农业科学院植物保护研究所, 植物病虫害生物学国家重点实验室, 北京, 100193
推荐引用方式
GB/T 7714
彭焕,彭德良,黄文坤. 甘薯茎线虫β-1,4内切葡聚糖酶基因(Dd-eng-1b)cDNA全长的克隆与序列分析[J]. 农业生物技术学报,2009,17(6):1035-1041.
APA 彭焕,彭德良,&黄文坤.(2009).甘薯茎线虫β-1,4内切葡聚糖酶基因(Dd-eng-1b)cDNA全长的克隆与序列分析.农业生物技术学报,17(6),1035-1041.
MLA 彭焕,et al."甘薯茎线虫β-1,4内切葡聚糖酶基因(Dd-eng-1b)cDNA全长的克隆与序列分析".农业生物技术学报 17.6(2009):1035-1041.
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