棉花病原菌碳水化合物酶类注释和比较分析

	棉花病原菌碳水化合物酶类注释和比较分析
	陈捷胤; 柳少燕; 李蕾; 戴小枫
刊名	中国农业科学
	2013-02-01
期号	03 页码:496-506
关键词	棉花病原菌碳水化合物酶类植物细胞壁降解酶基因家族扩增
英文摘要	【目的】预测并分析可侵染棉花的病原菌基因组编码的碳水化合物酶类CAZymes,以内生菌绿色木霉和枯草芽孢杆菌为对照,通过碳水化合物酶类家族比较分析确定与病原菌侵染相关的植物细胞壁降解酶类,为细胞壁降解酶参与病原菌侵染机理的研究提供理论依据。【方法】利用已公布的可侵染棉花的7个病原菌全基因组编码蛋白序列,以内生菌绿色木霉为参照,应用BLASTP方法确定共有的核心基因集并构建系统发育树;通过BLASTP方法对基因组编码蛋白的CAZymes进行注释,统计并比较分析病原菌与内生菌CAZymes各个家族基因的差异,获得病原菌相对于内生菌发生扩增的植物细胞壁降解酶类家族;应用MEGA4.0构建CAZym...
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语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://111.203.20.206/handle/2HMLN22E/2290]
专题	作物科学研究所_种质资源保存与研究中心
作者单位	中国农业科学院农产品加工研究所;中国农业科学院作物科学研究所
推荐引用方式 GB/T 7714	陈捷胤,柳少燕,李蕾,等. 棉花病原菌碳水化合物酶类注释和比较分析[J]. 中国农业科学,2013(03):496-506.
APA	陈捷胤,柳少燕,李蕾,&戴小枫.(2013).棉花病原菌碳水化合物酶类注释和比较分析.中国农业科学(03),496-506.
MLA	陈捷胤,et al."棉花病原菌碳水化合物酶类注释和比较分析".中国农业科学 .03(2013):496-506.