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题名基于方差和中值调整的RNA-Seq数据标准化方法及其评估; A Normalization Method Based on Variance and Median Adjustment for RNA-Seq Data and its Evaluation
作者王英
答辩日期2014 ; 2014
导师吉国力 ; 吴小惠
关键词RNA测序 标准化方法 评估 RNA Sequencing Normalization Method Evaluate
英文摘要随着新一代高通量测序技术的飞快发展,RNA测序技术(RNA-Seq)已经被广泛应用于各种生物的转录组分析中。由于不同的测序文库是由不同测序泳道产生的且测序深度有所不同,导致不同文库不能直接进行比较分析。因此,需要对测序文库序列数据进行标准化处理来调整不同测序泳道的总序列数,消除实验过程中测序技术上的误差,使能够更准确地分析基因的表达差异。 本文提出了最小方差中值标准化方法,基于方差和中值调整对RNA-Seq数据进行标准化,既考虑了测序文库中所有基因的表达水平对全局表达量的影响,又考虑到每个单一的基因表达量影响。本文利用该方法对拟南芥多聚腺苷化[ploy(A)]位点和基因数据集进行分析,基于几...; With the rapid development of the next generation sequencing, the RNA sequencing(RNA-Seq) is widely used in the analysis of transcriptomes of various organisms. As the different sequencing libraries are gained by the different sequencing lanes and the sequencing depths are different, these different libraries can not be directly compared. Therefore, these sequencing libraries must be normalized to...; 学位:工学硕士; 院系专业:信息科学与技术学院_系统工程; 学号:23220111153249
语种zh_CN
出处http://210.34.4.13:8080/lunwen/detail.asp?serial=45228
内容类型学位论文
源URL[http://dspace.xmu.edu.cn/handle/2288/84492]  
专题信息技术-学位论文
推荐引用方式
GB/T 7714
王英. 基于方差和中值调整的RNA-Seq数据标准化方法及其评估, A Normalization Method Based on Variance and Median Adjustment for RNA-Seq Data and its Evaluation[D]. 2014, 2014.
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