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从基于结构定义的序列模体识别蛋白质的超家族
黄京飞; 刘次全
刊名科学通报
2002
卷号47期号:8页码:591-595
关键词蛋白质酪氨酸磷酸酶 序列模体 超家族的序列识别 假定蛋白质 分子进化
ISSN号0023-074X
中文摘要以进化上相距较远的蛋白质酷氨酸磷酸酶I和II为例,通过结构比较和基于结构的序列比对及共同保守区域残基替换模式的分析,定义了基于结构的序列模体。利用这种新的模体对SWISS-PROT和TrEMBL蛋白质序列库进行搜索,可特异性地同时识别磷酸酶I和II,其识别正确率可达98.4%。而在此之前,尚未见可同时识别磷酸酶I和II序列模体的报道。
收录类别其他
资助信息国家自然科学基金(批准号:30170507,30024004);云南省自然科学基金及其主任基金(批准号:1999C0084M,98C007R)资助项目
原文出处2002478591.pdf
语种中文
公开日期2010-08-24
内容类型期刊论文
源URL[http://159.226.149.42:8088/handle/152453/2613]  
专题昆明动物研究所_结构生物信息学
昆明动物研究所_细胞与分子进化重点实验室
作者单位中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化重点实验室,昆明650223
推荐引用方式
GB/T 7714
黄京飞,刘次全. 从基于结构定义的序列模体识别蛋白质的超家族[J]. 科学通报,2002,47(8):591-595.
APA 黄京飞,&刘次全.(2002).从基于结构定义的序列模体识别蛋白质的超家族.科学通报,47(8),591-595.
MLA 黄京飞,et al."从基于结构定义的序列模体识别蛋白质的超家族".科学通报 47.8(2002):591-595.
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