基于全基因组正选择基因揭示大狐蝠和小棕蝠功能分化分子机制
曾燕妮1,3; 沈永义[*]2; 张亚平[*]3,4
刊名动物学研究
2013
卷号34期号:3页码:221−227
关键词小棕蝠 大狐蝠 正选择 适应性性进化 基因组
其他题名Genome-wide scan reveals the molecular mechanisms of functional differentiation of Myotis lucifugus and Pteropus vampyrus
通讯作者shenyy@xmu.edu.cn ; zhangyp@mail.kiz.ac.cn
合作状况其它
中文摘要小棕蝠 (Myotis lucifugus) 和大狐蝠 (Pteropus vampyrus)在生理和行为上有诸多差异,应被诉诸于分子水平并加以系统探讨。该研究对包括小棕蝠和大狐蝠在内的7 个哺乳动物全基因组同源编码序列进行了高质量比对,使用比对序列进行了分别以两个蝙蝠枝为前景枝的全基因组水平选择压力分析,并对两种蝙蝠中的正选择基因进行了富集聚类分析。结果表明,在小棕蝠枝受到正选择的基因数高于大狐蝠枝;两种蝙蝠中独立受到正选择的基因富集于不同的功能类别;且正选择基因的富集差异与小棕蝠和大狐蝠在免疫、运动协调、能量代谢和感觉器官发育等关键生物学功能方面的分化大体吻合。
英文摘要The physiological and behavioral differences between Myotis lucifugus and Pteropus vampyrus should be attributed to
molecular mechanisms and deserve intensive investigation. We conducted genome-wide scan for coding sequences from the
orthologue genes of seven mammalian species. Selection analyses were carried out by setting the branches leading to Myotis
lucifugus and Pteropus vampyrus as foreground branches, respectively. Enrichment analyses were conducted for positively selected genes. Our results indicated that more genes exhibited positive selection in Myotis lucifugus than that in Pteropus vampyrus. The positively selected genes of the two species were enriched in different functions. The differences between Myotis lucifugus and Pteropus vampyrus represented their differentiation in biological functions, especially the functions of immunity, motor ability, energetic metabolism and sensory organ development.
收录类别其他
资助信息国家自然科学基金(31172080,91231202).
语种中文
公开日期2013-06-14
内容类型期刊论文
源URL[http://159.226.149.42:8088/handle/152453/7466]  
专题昆明动物研究所_分子进化基因组学
昆明动物研究所_遗传资源与进化国家重点实验室
作者单位1.华东师范大学生命科学学院,上海200062
2.厦门大学生命科学学院,福建厦门361005
3.中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室,云南昆明650223
4.云南大学生物资源保护与利用实验室,云南昆明650091
推荐引用方式
GB/T 7714
曾燕妮,沈永义[*],张亚平[*]. 基于全基因组正选择基因揭示大狐蝠和小棕蝠功能分化分子机制[J]. 动物学研究,2013,34(3):221−227.
APA 曾燕妮,沈永义[*],&张亚平[*].(2013).基于全基因组正选择基因揭示大狐蝠和小棕蝠功能分化分子机制.动物学研究,34(3),221−227.
MLA 曾燕妮,et al."基于全基因组正选择基因揭示大狐蝠和小棕蝠功能分化分子机制".动物学研究 34.3(2013):221−227.
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