探讨rDNA ITS区作为果蝇Drosophila nasuta分子系统发育研究的价值

CORC > 昆明动物研究所 > 昆明动物研究所 > 遗传资源与进化国家重点实验室 > 分子进化基因组学

	探讨rDNA ITS区作为果蝇Drosophila nasuta分子系统发育研究的价值
	俞海菁 1,2; 张亚平[*]1; 林飞栈 3; 朱定良 2; 庚镇城 2
刊名	遗传学报
	2000
卷号	27 期号:1 页码:18-25
关键词	果蝇nasuta亚群核糖体 DNA 转录间隔区系统发育树 RNA二级结构
ISSN号	0379-4172
通讯作者	zhangyp@public.km.yn.cn
中文摘要	测定了果蝇ｎａｓｕｔａ亚群７个分类元和外群Ｄ．ｉｍｍｉｇｒａｎｓ的核糖体基因转录间隔区（ＩＴＳ，ｉｎｔｅｒｔｒａｎｓｃｒｉｂｅｄｓｐａｃｅｒ），包含５．８ＳｒＤＮＡ和２ＳｒＤＮＡ长约１．１ｋｂ的ＤＮＡ片段序列。结果表明：Ｄ．ｐａｌｌｉｄｉｆｒｏｎｓ、Ｔａｘｏｎ　ＬＴｕｏｎ　Ｊ享有共同的序列；Ｄ．ａｌｂｏｍｉｃａｎｓ则与Ｄ．ｓ．ｎｅｏｎａｓｕｔａ共享１个序列。序列之间存在少量的插入缺失和碱基替代。其中插入和缺失主要发生内外群之间，内群中只有Ｄ．ｎｉｖｅｉｆｒｏｎｓ发生１个碱基的插入和１２个碱基的缺失以及Ｄ．ｓ．ｓｕｌｆｕｒｉｇａｓｔｅｒ序列中１个碱基的缺失；而在包括外群在内的碱基替代中，共有５５次转换，６５次颠换，转换／颠换值与动物线粒体基因组十分不同。采用简约法和邻接法构建这７个分类元的系统发育关系。发现Ｄ．ｎｉｖｅｉｆｒｏｎｓ位于树的基部，与其他物种有较远的亲缘关系；Ｄ．ａｌｂｏｍｉｃａｎｓ、Ｄ．ｓ．ｎｅｏｎａｓｕｔａ、Ｄ．ｐａｌｌｉｄｉｆｒｏｎｓｓ、Ｔａｘｏｎ　Ｉ、ＴａｘｏｎＪ最接近，它们是亲缘关系最近的种类。讨论了Ｄ．ｓ．ｓｕｌｆｕｒｉｇａｓｔｅｒ和Ｄ．ｓ．ｎｅｏｎａｓｕｔａ相互接?
收录类别	其他
资助信息	国家自然科学基金;中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放实验室基金
原文出处	200027118.pdf
语种	中文
公开日期	2010-08-24
内容类型	期刊论文
源URL	[http://159.226.149.42:8088/handle/152453/2323]
专题	昆明动物研究所_分子进化基因组学昆明动物研究所_细胞与分子进化开放实验室
作者单位	1.中国科学院昆明动物研究所细胞及分子进化开放实验室,昆明650223 2.上海复旦大学遗传研究所;上海200433 3.台湾中央研究院动物研究所,中国台湾台北市
推荐引用方式 GB/T 7714	俞海菁,张亚平[*],林飞栈,等. 探讨rDNA ITS区作为果蝇Drosophila nasuta分子系统发育研究的价值[J]. 遗传学报,2000,27(1):18-25.
APA	俞海菁,张亚平[*],林飞栈,朱定良,&庚镇城.(2000).探讨rDNA ITS区作为果蝇Drosophila nasuta分子系统发育研究的价值.遗传学报,27(1),18-25.
MLA	俞海菁,et al."探讨rDNA ITS区作为果蝇Drosophila nasuta分子系统发育研究的价值".遗传学报 27.1(2000):18-25.