题名地衣芽孢杆菌GXN151纤维素酶基因的克隆与表达; Cloning and expression of cellulase genes from Bacillus licheniformis GXN151 in Escherichia coli
作者刘永生
学位类别博士
答辩日期2003
授予单位中国科学院沈阳应用生态研究所
授予地点中国科学院沈阳应用生态研究所
关键词地衣芽抱杆菌 基因文库 克隆 纤维素酶基因 表达
其他题名Cloning and expression of cellulase genes from Bacillus licheniformis GXN151 in Escherichia coli
学位专业微生物学
中文摘要从广西大学农场陈旧稻草堆、甘蔗渣堆、龙胜温泉等地采集不同的土样和水样,从中共分离到10株能降解结晶纤维素的细菌、放线菌和真菌,对它们的165RNA或185 rRNA基因序列进行了分析,其中从稻草堆中分离到的好氧细菌GXN 151具有耐中温、生长迅速、能降解天然纤维素的特点。运用生理生化和电镜观察进一步将其鉴定为地衣芽抱杆菌。用pUC18和pBluescript KS+作载体,分别以CoR工和品u3AI部分酶切的GXN 151的总DNA作目的片段,在大肠杆菌中构建了地衣芽抱杆菌GXN151的2个基因文库。运用含狡甲基纤维素的平板筛选法,从GXN151的基因文库中共筛选到14个表达梭甲基纤维素酶(CMCase)活性的克隆,采用酶切分析、亚克隆、Southern杂交、DNA测序分析将这些克隆划分为3类不重叠克隆群。pGxNLI、pGXNLZ、pGxNL7、pGxNP12和pGxNPI~pGXNP6共10个克隆归为一类重叠克隆,测序分析了PGXNLZ的序列,其长度为3672bP,其上含有一个完整的长1626 bp的ORF(GenBonk索引号为AY291583),可编码一个含542个氨基酸的内切葡聚糖酶Ce15A,其预计分子量为59,625D娜Ce15A含有家族5糖基水解酶催化功能域和家族3碳水化合物结合组件(CBM3)。PCR 扩增了ceJSA的编码框并将其克隆到大肠杆菌表达载体pET-30a(+)上,酶谱分析表明该基因在大肠杆菌JM109(DE3)和BL21(DE3) pLysS中均表达出具梭甲基纤维素酶活性的蛋白质产物。克隆pGxNLg测序共得5818bp,pGxNLg序列中含有一个完整的内切葡聚糖酶基因cel12A(GenBaok索引号为AY291066)和一个外切-Q-葡萄糖营酶基因amyA,cel12A长783 bp,可编码含261个氨基酸的蛋白质,预计分子量为29,035 Da,含有一个家族12糖基水解酶催化功能域。amyA为1680bP,推断其编码含560个氨基酸的蛋白质,预计分子量为65,121 Da。PCR扩增了cel12A基因的含催化功能域编码区的DNA序列并连接到表达载体pET30a(+)上得表达质粒pGxN12A,pGXN 12A在大肠杆菌JM1O9(DE3)和BL21(DE3)pLysS中均J高效表达,并对表达条件进行了研究。克隆pGXNLS、pGXNPS和pGXNpn为一类重叠克隆,测序表明pGxNPll克隆的序列共为3406bP,它包括了一个完整的内切葡聚糖酶基因ce19A和一个不完整的纤维二糖水解酶基因ce148A,ce19A基因由1899bP组成,可编码一个含633个氨基酸的蛋白质,预计分子量为71,240Da。ce19A基因的产物Ce19A含有一个家族9糖基水解酶催化功能域和一个家族3碳水化合物结合组件(CBM3)。Ce148A属于糖基水解酶第4S家族,DNA杂交表明cel48A基因的未被克隆的下游序列位于一个约10kb的SaLI片段或4kb的EcoRI片段上。
语种中文
公开日期2010-12-15 ; 2011-04-29
页码132
内容类型学位论文
源URL[http://210.72.129.5/handle/321005/3261]  
专题沈阳应用生态研究所_沈阳应用生态研究所_学位论文
推荐引用方式
GB/T 7714
刘永生. 地衣芽孢杆菌GXN151纤维素酶基因的克隆与表达, Cloning and expression of cellulase genes from Bacillus licheniformis GXN151 in Escherichia coli[D]. 中国科学院沈阳应用生态研究所. 中国科学院沈阳应用生态研究所. 2003.
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